SMAS 7 September’99 adalah sekolah yang berdiri sejak pengungsian masyarakat Timor Timur pasca jajak pendapat tahun 1999 di bawah tenda atau gedung penanggulangan bencana dari 22 tahun yang lalu. Tahun 1999 merupakan suatu kenangan yang tidak terlupakan dalam bingkai kehidupan warga baru yang sangat berarti untuk kami dalam membangun pelayanan pendidikan bagi anak-anak miskin, terlantar, bermasalah atau yang tidak tertangani dengan baik.